С 1 февраля 2009 года (интронизация) предстоятель Церкви — патриарх Московский и всея Руси Кирилл, избранный на патриарший престол 27 января того же года на Поместном соборе РПЦ. С 6 декабря 2008 года и до избрания патриархом он был местоблюстителем патриаршего престола.
Согласно этому документу, предстоятель Русской православной церкви носит титул «Святейший Патриарх Московский и всея Руси», имеет первенство чести среди епископов Русской православной церкви и подотчётен Поместному и Архиерейскому соборам.
Согласно принятому уставу, церковь возглавляет предстоятель с титулом «Митрополит Киевский и всея Украины». С 15 декабря 2018 года в этой должности — митрополит Епифаний (Думенко), бывший митрополит Переяславский и Белоцерковский УПЦ КП.
Соблюдается следующая иерархия: Епископы: 1. Патриархи, Архиепископы, Митрополиты – Главы Церквей Поместных.